Uostas ir miesto valdžia nesutaria dėl uosto plėtros. Liepą miestotaryba pritarė bendrojo plano keitimo variantui, pagal kurį artimiausią dešimtmetį nėra numatyta statyti išorinį uostą .
Tačiau jei Vyriausybė nutars kitaip, miesto valdžios sprendimas neturės jokių pasekmių uosto plėtrai. Susisiekimo ministerija jau pritarė bendrojo plano koncepcijai, numatančiai maksimalią uosto plėtrą tiek pietinėje, tiek šiaurinėje miesto dalyje, įskaitant išorinio uosto statybą Melnragėje.
Premjeras anksčiau yra teigęs, jog svarstant uosto plėtrą, turi būti suderinti miesto, gyventojų ir uosto interesai. Nesugebėjimą suderinti skirtingus interesus kaip pagrindinę problemą uosto plėtrai mini ir susisiekimo ministras R. Masiulis.
Siekiant užtikrinti miesto ir Vyriausybės bendradarbiavimą ir dialogą, nuo šių metų rugpjūčio Klaipėdos uosto valdyboje dirba uostamiesčio meras Vytautas Grubliauskas. Gerosios valdymo praktikos ekspertai kritikuoja tokį sprendimą ir įžvelgia galimą interesų konfliktą.