16 NEBL pirmenybių komandų žais pagal vieno rato sistemą. Dvi geriausios reguliariojo sezono ekipos iškart pateks į finalinį keturių komandų turnyrą, o 3 - 10 vietas užėmę klubai žais atkrintamosiose varžybose, kuriose po ketvirtfinalio bei pusfinalio paaiškės dvi likusios finalininkės. Baigiamasis NEBL čempionato, kuriame paaiškės turnyro nugalėtojas bei prizininkai, turas vyks balandžio 21-22 dienomis. Finalinių varžybų vieta paaiškės vėliau.
Antrajame NEBL čempionate debiutuos Anglijos, Čekijos, Olandijos ir Lenkijos klubai: Londono "Towers", Prahos "USK-Erpet", Den Helderio "Coneco" ir Varšuvos "Polonia". Palyginti su pirmuoju sezonu (14 komandų iš 9 valstybių), lygoje nebus Vokietijos komandos (Frankfurto "Skyliners"), Alytaus "Alitą" pakeitė Šiaulių "Šiauliai", vietoje dviejų ekipų Švedijai ir Suomijai atstovaus po vieną komandą. Be Maskvos CSKA, antroji Rusijos komanda NEBL čempionate - Permės "Ural-Greit".
Kaip spaudos konferencijoje teigė NEBL komisaras Šarūnas Marčiulionis, čempionato prizų fondas turėtų būti ne mažesnis nei praėjusį sezoną - 100 tūkst. JAV dolerių (400 tūkst. litų). Jo teigimu, perspektyvoje planuojama finansiškai skatinti net tik į finalinį ketvertą patekusias komandas, bet ir ekipas, kurios iškops į atkrintamąsias NEBL varžybas.
2001 metų sausio ir vasario mėnesiais startuos NEBL "Iššūkio taurės" ("Challenge Cup") turnyras, kuris komandoms taps atrankos etapu į 2001-2002 metų sezono NEBL čempionatą.