Į trečiąjį "Intertoto" varžybų etapą iškopė Čekijos, Kroatijos (2), Prancūzijos (2), Vokietijos, Šveicarijos ir Belgijos klubai (skliaustuose - pirmojo antrojo etapo mačo rezultatas):
Jeruzalės "Beitar" (Izraelis) - Libereco "Slovan" (Čekija) 1:2 /1:5/
Bistricos "Gloria" (Rumunija) - Belupo "Slaven" (Kroatija) 0:1 /2:3/
Turku "Inter" (Suomija) - Varaždino "Varteks" (Kroatija) 2:2 /3:4/
Poznanės "Lech" (Lenkija) - "RC Lens" (Prancūzija) 0:1 /1:2/
Noišatelio "Xamax" (Šveicarija) - "St Etienne" (Prancūzija) 1:2 /1:1/
Prilepo "Pobeda" (Makedonija) - "Hamburger SV" (Vokietija) 1:4 /1:4/
"Young Boys" (Šveicarija) - "Lokeren" (Belgija) 2:1 /2:0
Žlino "Tescona"" (Čekija) - "Ghent" (Belgija) 0:0 /0:1/
Trečiajame etape Vilniaus "Žalgirio" varžovu bus Graikijos "Egaleo" klubas. Pirmąsias rungtynes savaitgalį vilniečiai žais svečiuose, o liepos 23-čiąją - namuose. Pergalės atveju "Žalgirio" varžovu turnyro pusfinalyje bus Klužo "CFR Ecomax" (Rumunija) klubas arba "Saint-Etienne" (Prancūzija) ekipa. Būtent Rumunijos komanda pirmajame UEFA "Intertoto" turnyro etape iš tolesnės kovos eliminavo Vilniaus "Vėtros" ekipą.
Likusios UEFA "Intertoto" turnyro trečiojo etapo poros:
Romos "Lazio" (Italija) - "Tampere United" (Suomija)
"Young Boys" (Šveicarija) - Marselio "Olympique" (Prancūzija)
Dubnicos ZTS (Slovakija) - "Newcastle United" (Anglija)
Leirijos "Uniao" (Portugalija) - "Hamburger SV" (Vokietija)
"Gent" (Belgija) - "Valencia" (Ispanija)
Dortmundo "Borussia" (Vokietija) - Olomouco "Sigma" (Čekija)
Kerkradės "Roda JC" (Olandija) - Libereco "Slovan" (Čekija)
La Korunjos "Deportivo" (Ispanija) - Belupo "Slaven" (Kroatija)
"IFK Goeteborg" (Švedija) - "VfL Wolfsburg" (Vokietija)
Varaždino "Varteks" (Kroatija) - "RC Lens" (Prancūzija)