Antrajame etape dalyvaus keturios ekipos iš LFF pirmosios (I) lygos, trys atstovai iš antrojo (II) diviziono, aštuonios komandos atstovaus trečiajai (III), viena - ketvirtajai (IV) lygai.
Burtai į vieną porą suvedė LFF I lygos ir II lygos Pietų zonos lyderius. Sostinėje dėl kelialapio į kitą etapą kovos Vilniaus "Gariūnai" ir "Klaipėdos Granitas".
Penktąją vietą I lygos pirmenybėse užimantis Kazlų Rūdos "Šilas" išvykoje bandys perkopti II lygos Pietų zonos vieno iš favoritų Mykolo Romerio Universiteto komandos barjerą, o kitas I lygos dalyvis Panevėžio "Baltija" bandys įveikti III lygos ekipą Vilniaus "Rytą".
Kauniečiai turės progą išvysti dviejų šių miesto komandų dvikovą - Futbolo bendruomenės klubas "Kaunas" susigrums su "Spyrio" klubu.
Trečiajame etape bus galima išvysti net keturias ekipas iš žemesnių Lietuvos lygų. Burtai lėmė, jog tarpusavyje dėl kelialapio į kitą etapą kovos aštuonios komandos iš III ir IV lygų.
Antrojo etapo rungtynės turi būti sužaistos iki rugpjūčio 31 dienos. Trečiajame etape į taurės turnyrą įsijungs septynios LFF I lygos komandos - Radviliškio "Lokomotyvas", "Palanga", "Šilutė", Vilniaus "Polonija", "Trakai", Kėdainių "Nevėžis", Jonavos "Lietava" ir "SMScredit.lt A lygos" čempionate dalyvaujantis Tauragės "Tauras".
2013-2014 metų LFF "Druskininkų Hermio" taurės II etapo dalyviai:
Klaipėdos "Kuršiai" (III, Klaipėdos apskritis) - Marijampolės "Švyturys" (III, Marijampolės apskritis)
Vilniaus "TAIP" (III, Vilniaus) - Panevėžio "Baltija" (I)
Vilniaus "Rytas" (IV) - Šiaulių "Kupsc" (III, Šiaulių)
Vilniaus MRU (II, Pietų) - Kazlų Rūdos "Šilas" (I)
Kauno "United" (III, Kauno) - Šiaulių raj. "Savanoris" (III, Šiaulių)
Šiaulių "Medelynas" (III lyga, Šiaulių apskritis) - Šiaulių "Saulininkas" (III, Šiaulių)
F.B.K. "Kaunas" (II, Pietų) - Kauno "Spyris" (I lyga)
Vilniaus "Gariūnai" (II, Pietų) - "Klaipėdos Granitas" (I)