Ekonomikos institute dirba 14 darbuotojų, iš jų 6 - puse etato. Pažymima, kad atleidžiamiems instituto darbuotojams 2010 metais reikės išmokėti beveik 200 tūkst. Lt įvairių išmokų.
Lietuvos mokslų akademijos, vykdančios Ekonomikos instituto steigėjo funkcijas, prezidiumas šių metų vasarą nutarė nutraukti Ekonomikos instituto veiklą ir įkurti Lietuvos ekonomikos mokslinių tyrimų institutą, tačiau naujo instituto steigimo galimybė numatoma svarstyti pagerėjus šalies finansinei situacijai.
Lietuvos mokslų akademijai, numatoma pavesti iki 2009 metų pabaigos atlikti visus veiksmus likviduojant valstybės mokslo įstaigą Ekonomikos institutą ir išregistruoti šią įstaigą iš Juridinių asmenų registro.
Ekonomikos institutas buvo įsteigtas 1941 m., po Antrojo pasaulinio karo jo veikla atkurta. Tuomet veikė 11 mokslinių padalinių - 9 skyriai, 2 laboratorijos. Sovietmečiu daugėjo instituto darbuotojų. 1990 m. pradžioje institute dirbo daugiau kaip 180 darbuotojų, iš jų 126 mokslo darbuotojai.
Atkūrus Lietuvos nepriklausomybę institutas reorganizuotas - panaikinta buvusi struktūra, apie 10 kartų sumažintas darbuotojų skaičius, pakeistos mokslinės veiklos kryptys.
Ekonomikos institutui sovietmečiu vadovavo Juozas Bulavas, Kazimieras Meškauskas, Juozas Maniušis. 1985-2008 m. Ekonomikos instituto direktoriumi buvo akademikas Eduardas Vilkas.
Lietuvos mokslininkų sąjungos duomenimis, šiuo metu šalyje veikia 25 valstybiniai mokslo institutai ir 18-a universitetų mokslo institutų.