J. Pagojus konkursą VVTAT direktoriaus vietai užimti laimėjo dar vasarą. Tuomet opozicinės konservatorių frakcijos Seime narys Jurgis Razma įtarė, kad teisingumo ministras socialdemokratas Juozas Bernatonis protegavo teisingumo viceministrą, taip pat socialdemokratą J. Pagojų į VVTAT direktoriaus pareigas. Tačiau Valstybės tarnybos departamentas, atlikęs tyrimą, pažeidimų nenustatė.
J. Pagojus konkursą į Teisingumo ministerijai pavaldžios VVTAT direktoriaus pareigas laimėjo įveikęs penkis konkurentus.
Nuo 2014 m. liepos. J. Pagojus ėjo teisingumo viceministro pareigas.
Vilniaus universitete ekonomikos bakalauro bei teisės magistro studijas baigęs 28-erių J.Pagojus yra dirbęs advokato padėjėju, nuo 2012 metų gruodžio iki tapimo viceministru dirbo teisingumo ministro patarėju, yra vadovavęs kelioms Lietuvos jaunimo organizacijoms.