Tai - negrynojo kalkakmenio arba karstinė urvų sistemą, kurią sudaro storas 213 m. kalkakmenio sluoksnis, nuolat graužiamas prasisunkiančių požeminių vandenų.

Tamsieji Mamutų urvų kanalai kadaise buvo keliai, vedę prie požeminių vandens šaltinių, įtekančių į šalia esančią Žaliąją upę. Upei prasigraužus pro uolų apačią, prasigraužė ir požeminai vandenys sudarydami didžiulį dabartinį urvų kompleksą.

Kalkakmenis per 70 mln. metų nusėdo ant jūros dugno. Jūra čia tyvuliavo prieš 350 mln. metų.